Come calcolare relativa Gene Expression

Quando due organismi genitore , non importa la specie , creano un nuovo organismo , entrambi i genitori contribuiscono materiale genetico . Quando i geni combinano informazioni , il risultato è la formazione di proteine ​​o RNA funzionale ( acido ribonucleico ) , a seconda del tipo di gene . Per quantificare l'espressione relativa di un particolare gene genitore nel prodotto finito , si avrebbe bisogno di testare la quantità di tale gene in un campione sperimentale in relazione alla quantità dello stesso gene in un controllo o campione di calibrazione . Istruzioni
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Scegliere un campione calibratore per servire come base . Se siete alla ricerca di un particolare prodotto del gene codificate , o RNA specifico , allora si dovrebbe scegliere un organo o organello che avrà la minor quantità di tale prodotto . Se siete alla ricerca di c - myc umano mRNA , ad esempio, utilizzare campioni di cervello come calibratori .
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Raduna i tuoi dati dal campione e calibratore . Questo processo può variare ampiamente , data l'estrema diversità di specie che passano giù codifica genetica da una generazione all'altra . Nell'esempio di campionamento umana , si potrebbe ottenere campioni di organi da una casa di approvvigionamento scientifica e applicare il reagente specifico a tale organo. Dopo il reagente reagisce con il vostro campione , verrà lasciato con un valore di concentrazione per quel campione , e un altro valore per il campione di calibrazione .
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Generare un foglio di calcolo utilizzando Microsoft Excel che ha la seguenti colonne: tipo di campione, nanogrammi di RNA bersaglio , il logaritmo di tale valore di nanogrammi , e il ciclo soglia , noto anche come C ( t ) . Quest'ultimo valore indica il punto in cui il campione dà abbastanza di un segnale di fluorescenza da rilevare. Minore è questo C ( t ) il valore , maggiore è la concentrazione di RNA che si sta cercando .
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Utilizzare il logaritmo delle nanogrammi e il ciclo soglia valori y your- x e in un diagramma a dispersione XY , utilizzando la procedura guidata grafico in Excel .
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Seleziona uno dei punti dati a caso e fare clic su di esso . Poi, vai a "Inserisci " e " Trendline " per eseguire una retta passante per quel punto. Vai a "Tipo" e scegliere " regressione lineare ".
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Scegli "Opzioni" e quindi contrassegnare le caselle accanto a "Display Equation su Chart" e "Display valore R al quadrato sul grafico . " Questo grafico vi darà una curva con l'espressione genica relativa , che vi mostra la concentrazione relativa di RNA in ciascun campione .